أدان الأزهر التدخل العسكري الفرنسي في دولة مالي معتبرًا إياه تصرفًا غير مشروع، كما انتقد في الوقت نفسه السلوك "الأحمق للمتشددين" في شمال مالي. وقال الأزهر في بيان له "الأزهر الشريف إذ يدين التدخل العسكري الفرنسي في دولة مالي الشقيقة يقرر أن السلوك الأحمق الهدام الذي قام به الغلاة المتشددون في شمال دولة مالي، وفي منطقة أزواد وغيرها هو الذي تسبب في الهجمة الفرنسية الباغية وأعطى الفرصة لإزهاق الأرواح وتهديد البلاد والعباد، في هذه المناطق المسلمة". وتابع البيان "الأزهر من واقع مسئوليته الدينية والتاريخية يعلن إدانته لكل ذلك". ودعا الأزهر إلى وقف الهجوم العسكري الأجنبي، وتوقف ما أسماها "التصرفات الحمقاء المخالفة لصحيح الدين في نبش مقابر المسلمين وتبديد تراثهم ومكتباتهم، وهدم مؤسساتهم الحضارية والدينية".